実際にその場に居ないので状況が掴めませんが、先ずは褒められてるのかけなされているのかは判断出来ますよね。

現実に相手より勉強が出来れば褒められてる訳で、実際は相手より頭が悪いのに逆の事言われたのだったらからかわれてる訳です。

普通ならば、前者だと思うので自然に有難うと返すか、「いやそんな事無いよ」と、冗談っぽくさらりと返せばいい訳で頭にくること自体が解せません。

又、前者であれば相手はあなたに遠回しに勉強の仕方を聞いているのか又は、あなたと友達になりたいのかも分かりませんよ……。

もし、後者であれば「良くそんな逆な事言えるね。親の顔見たいよ」で、返して今後一切相手しなければ良いことです。

先ずは相手がどういう気持ちで言ってるのかを心理分析する必要があります。
人間関係はあまり神経質にならない方がいいと思いますよ。